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Labs

[R]OSXでRcmdrインストール (2018/04/28): OSX(High Sieera)でRcmdr をインストールしてもエラーとなった。

> install.packages("Rcmdr", dependencies = TRUE)
....
> library(Rcmdr)
Error : .onAttach は attachNamespace()（'Rcmdr' に対する）の中で失敗しました、詳細は:
call: structure(.External(.C_dotTclObjv, objv), class = "tclObj")
error: [tcl] invalid command name "image".

XQuartz インストール

Rcmdr はX11アプリで起動するため、XQuartzをインストール＆起動しておかなければいけない。
https://www.xquartz.org/
RStudioを再起動し、XQuartzを起動した状態で、Rcmdr を読み込むと起動した。

[R]RStudio環境の作成 (2018/04/07)

Mac でも R 環境が利用できる。
ただ、XCodeを予めインストールしておいた方が良さそうだ。
（自分は予めXCodeを入れていたので未確認）
* 2018/4 時点では「ElCapitan」対応だが、差し当たり「HighSierra」でも動作している。

Rインストール

The Comprehensive R Archive Network

$ R --version
R version 3.4.4 (2018-03-15) -- "Someone to Lean On"
Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)

RStudioインストール

RStudio
コンソール等でプログラムを簡単に確認できる。
RStudio

日本語化

ホームに「.RProfile」を作成し以下を記述する
*参考：RStudio for Mac OS X で日本語のプロットが上手くいかない場合の対処法

setHook(packageEvent("grDevices", "onLoad"),

    function(...){

        if(.Platform$OS.type == "windows")

            grDevices::windowsFonts(sans ="MS Gothic",

                                    serif="MS Mincho",

                                    mono ="FixedFont")

        if(capabilities("aqua"))

            grDevices::quartzFonts(

              sans =grDevices::quartzFont(

                c("Hiragino Kaku Gothic Pro W3",

                  "Hiragino Kaku Gothic Pro W6",

                  "Hiragino Kaku Gothic Pro W3",

                  "Hiragino Kaku Gothic Pro W6")),

              serif=grDevices::quartzFont(

                c("Hiragino Mincho Pro W3",

                  "Hiragino Mincho Pro W6",

                  "Hiragino Mincho Pro W3",

                  "Hiragino Mincho Pro W6")))

        if(capabilities("X11"))

            grDevices::X11.options(

                fonts=c("-kochi-gothic-%s-%s-*-*-%d-*-*-*-*-*-*-*",

                        "-adobe-symbol-medium-r-*-*-%d-*-*-*-*-*-*-*"))

        grDevices::pdf.options(family="Japan1GothicBBB")

        grDevices::ps.options(family="Japan1GothicBBB")

        }

)

attach(NULL, name = "JapanEnv")

assign("familyset_hook",

       function() {

            winfontdevs=c("windows","win.metafile",

                          "png","bmp","jpeg","tiff","RStudioGD")

            macfontdevs=c("quartz","quartz_off_screen","RStudioGD")

            devname=strsplit(names(dev.cur()),":")[[1L]][1]

            if ((.Platform$OS.type == "windows") &&

                (devname %in% winfontdevs))

                    par(family="sans")

            if (capabilities("aqua") &&

                devname %in% macfontdevs)

                    par(family="sans")

       },

       pos="JapanEnv")

setHook("plot.new", get("familyset_hook", pos="JapanEnv"))

setHook("persp", get("familyset_hook", pos="JapanEnv"))

パッケージのインストール

RStudio のコマンド

install.packages("パッケージ名")

でパッケージをインストールできる。
例）
> install.packages("knitr")

MeCabインストール

オープンソースの形態素解析エンジン
文法を解析できる。
MeCabから「mecab-0.996.tar.gz」（2018/3時点）をダウンロードしてソースインストール

$ tar zxvf mecab-0.996.tar.gz
$ cd mecab-0.996
$ ./configure --with-charset=utf-8
$ make
$ sudo make install

$ tar zxvf mecab-ipadic-2.7.0-20070801.tar.gz
$ cd mecab-ipadic-2.7.0-20070801
$ ./configure --with-charset=utf-8
$ make
$ sudo make install

$ mecab
日本
日本名詞,固有名詞,地域,国,*,*,日本,ニッポン,ニッポン
EOS

RMeCabインストール

RStudio のコンソールで以下を実行する

> install.packages("RMeCab", repos = "http://rmecab.jp/R", type = "source")

[OSX]gem install エラーの対処 (2018/04/06): Mac（OSX）で gem install するとデフォルトではエラーになるので、XCodeコマンドラインをインストールしておく。

XCodeコマンドラインインストール

$ sudo xcode-select --install

/usr/local/bin 環境変数登録

$ echo 'export PATH=/usr/local/bin:$PATH' >> .bash_profile
$ source .bash_profile

最新 ruby を利用したり、sudo など省きたい場合は、brew で別途 ruby をインストール・設定する。

gem 環境確認

$ gem environment
- RUBYGEMS VERSION: 2.4.6
- RUBY VERSION: 2.0.0 (2015-12-16 patchlevel 648) [universal.x86_64-darwin16]
- INSTALLATION DIRECTORY: /Library/Ruby/Gems/2.0.0
- RUBY EXECUTABLE: /System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.0/usr/bin/ruby
- EXECUTABLE DIRECTORY: /usr/bin
- SPEC CACHE DIRECTORY: /Users/yoo/.gem/specs
- SYSTEM CONFIGURATION DIRECTORY: /Library/Ruby/Site
- RUBYGEMS PLATFORMS:
- ruby
- universal-darwin-16
- GEM PATHS:
- /Library/Ruby/Gems/2.0.0
- /Users/yoo/.gem/ruby/2.0.0
- /System/Library/Frameworks/Ruby.framework/Versions/2.0/usr/lib/ruby/gems/2.0.0
- GEM CONFIGURATION:
- :update_sources => true
- :verbose => true
- :backtrace => false
- :bulk_threshold => 1000
- REMOTE SOURCES:
- https://rubygems.org/
- SHELL PATH:
- /Users/yoo/.rbenv/shims
- /Users/yoo/.rbenv/bin
- /Users/yoo/.nodebrew/current/bin
- /usr/local/bin
- /usr/bin
- /bin
- /usr/sbin
- /sbin
- /opt/X11/bin
- /usr/local/share/dotnet
- /Library/Frameworks/Mono.framework/Versions/Current/Commands

Sassインストール

$ sudo gem install -n /usr/local/bin sass

gemリスト

$ gem list

*** LOCAL GEMS ***

bigdecimal (1.2.7, 1.2.0)
CFPropertyList (2.3.0, 2.2.8)
chunky_png (1.3.4)
compass (1.0.3)
compass-core (1.0.3)
compass-import-once (1.0.5)
daemons (1.2.4)
ffi (1.9.8)
io-console (0.4.2)
json (1.7.7)
libxml-ruby (2.8.0, 2.6.0)
mini_portile (0.6.2)
minitest (5.5.1, 4.3.2)
multi_json (1.11.0)
nokogiri (1.5.6)
oauth (0.5.4)
power_assert (0.2.3)
psych (2.0.0)
rake (10.4.2, 0.9.6)
rb-fsevent (0.9.4)
rb-inotify (0.9.10, 0.9.5)
rdoc (4.2.0, 4.0.0)
rubygems-update (2.4.6)
sass (3.5.6, 3.4.13)
sass-listen (4.0.0)
sqlite3 (1.3.10, 1.3.7)
test-unit (3.0.9, 2.0.0.0)

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